陳可萱 助研究員

實驗室主持人

Dr. 陳可萱

助研究員

PhD, Duke University, Department of Biology, 2017

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辦公室: 跨領域 C306(暫時)

電話:+886-2-2787-2260

研究領域
  • 真菌學
  • 植物-真菌互動
  • 植物及土壤微生物相
  • 真菌系統分類
  • 群集及功能生態學

研究方向

  • 植物跟真菌在自然環境中時常共同生存,但兩者的互動關係可從互利共生,片利共生,乃至寄生關係。由於各類共生關係的建立及維持通常是奠基於植物及真菌兩方持續的溝通以及利益交換之上,這些有趣的互動關係不但會影響到各種植物所依存的真菌相,長期的共演化關係也塑造了形形色色的真菌及植物多樣性。植物及真菌在自然環境中共同影響元素循環及生態系功能,了解植物及真菌在自然界中的依存關係將幫助我們了解當環境出現變化時(例如氣候變遷,棲地破壞,乃至於物種入侵),生態系統是否仍能維持。

     

    針對植物及真菌共生,我們將採取整合型的研究方法及取向,主要以次世代定序技術,輔助以植物/真菌表型及環境中的生物/非生物性資料,來瞭解台灣及鄰近地區森林及農業系統中的幾個問題:

    -群集生態學:植物的多樣性及分布如何塑造其所依附的真菌相?

    -功能生態學:植物及真菌的共生如何建立及維持,真菌在植物中的功能性為何?而其交互作用的動態又受到何種環境因子影響?

    -真菌系統分類:在這些植物共生菌中,是否尚有隱藏的真菌多樣性(例如未被描述的分類群)等待我們去發掘?而這些分類群與其他類真菌之親緣關係為何?

     

    目前執行研究的系統主要為:

    • 苔蘚依附之真菌

    苔蘚為植物界中最早演化出能在陸地上之生存的分類群,了解其與所依附之真菌互動關係能為植物-真菌共演化提供關鍵性的資訊。

    • 外生菌根菌

    外生菌根菌普遍認為能幫助植物獲取氮並從植物宿主獲取含碳養份。由於外生菌根菌及植物宿主常具有高度專一性,因此提供了絕佳的機會可以了解植物及真菌互相辨認及共生關係之建立。

    • 草類(禾本科)地上部附生菌

    植物葉面的附生真菌鮮少被研究,也因此此類真菌對植物的影響,包含可能為植物帶來的益處或危害也未知。數種農業上重要的禾本科植物已知有植物附生真菌,也因此,了解這類真菌跟植物的互動也與人類及動物健康息息相關。

 

最新發表

期刊論文 ( 2017 - 2020 )

  1. Chen Ko‐Hsuan, Liao Hui‐Ling, Bellenger Jean‐Philippe, Lutzoni François, 2019, “Differential gene expression associated with fungal trophic shifts along the senescence gradient of the moss Dicranum scoparium”, Environmental Microbiology, 21(7) 2273-2289. (SCI) (IF: 4.974; SCI ranking: 16.7%) Link
  2. Beule Lukas, Chen Ko-Hsuan, Hsu Chih-Ming, Mackowiak Cheryl, Dubeux Jr. Jose C.B., Blount Ann, Liao Hui-Ling, 2019, “Soil bacterial and fungal communities of six bahiagrass cultivars”, PeerJ, 7 e7014. (SCI) (IF: 2.118; SCI ranking: 29.7%) Link
  3. Bonito Gregory, Benucci Gian Maria Niccolò, Hameed Khalid, Weighill Deborah, Jones Piet, Chen Ko-Hsuan, Jacobson Daniel, Schadt Christopher, Vilgalys Rytas, 2019, “Fungal-Bacterial Networks in the Populus Rhizobiome Are Impacted by Soil Properties and Host Genotype”, Frontiers in Microbiology, 10. (SCI) (IF: 4.019; SCI ranking: 25.4%) Link
  4. Chen Ko-Hsuan, Blount Ann, Justesen Brittany, Walter Joseph H., Wallau Marcelo, Liao Hui-Ling, 2019, “First Report of the Association of Myriogenospora atramentosa with the Plant Genus Hemarthria”, Plant Health Progress, 244-246. Link
  5. Chen Ko-Hsuan, Liao Hui-Ling, Arnold A. Elizabeth, Bonito Gregory, Lutzoni François, 2018, “RNA-based analyses reveal fungal communities structured by a senescence gradient in the moss Dicranum scoparium and the presence of putative multi-trophic fungi”, New Phytologist, 218(4) 1597-1611. (SCI) (IF: 7.433; SCI ranking: 3.1%) Link
  6. Korotkin Hailee B., Swenie Rachel A., Miettinen Otto, Budke Jessica M., Chen Ko-Hsuan, Lutzoni François, Smith Matthew E., Matheny P. Brandon, 2018, “Stable isotope analyses reveal previously unknown trophic mode diversity in the Hymenochaetales”, American Journal of Botany, 105(11) 1869-1887. (SCI) (IF: 2.788; SCI ranking: 22%) Link